Kinerja STAI Sayid Sabiq Indramayu diukur dan dinilai berdasarkan hasil monitoring dan evaluasi pelaksanaan kegiatan dan serapan anggaran yang dilakukan di masing-masing unit STAI Sayid Sabiq Indramayu yang mencakup bidang akademik dan non akademik. Monitoring dan evaluasi dilakukan berdasarkan target–target capaian yang telah ditetapkan oleh masing – masing unit kerja yang tertuang dalam renstra unit kerja dan institusi. Hasil monitoring dan evaluasi disusun dalam sebuah buku laporan kinerja STAI Sayid Sabiq Indramayu yang dilakukan setiap enam bulan sekali. Laporan kinerja ini merupakan rujukan unit kerja lingkup STAI Sayid Sabiq Indramayu untuk menyusun program kerja kedepannya, sehingga diharapkan sasaran dan target kerja yang telah disusun dalam renstra menjadi tercapai sesuai dengan target yang telah ditetapkan. Capaian kinerja sekolah tinggi pada tiga tahun ini yakni melakukan pembenahan dalam bidang akademik yakni menata ulang kurikulum. Kemudian pengembangan dosen dengan mengirimkan dosen untuk studi lanjut pada jenjang doktoral. Kemudian pada aspek kesejahteraan dalam 3 tahun terakhir ada 4 orang dosen yang telah tersertifikasi dari kementerian agama. Pada bidang kemahasiswaan yakni terdapat kenaikan jumlah peminat antara 5-7% setiap tahunnya.
